河南省水产动物疾病控制工程研究中心于2013年7月经河南省发展和改革委员会获准立项建设。研究中心总体目标是建设高水平的水产动物疾病控制技术和产品研发的科技创新和社会服务平台。目前已形成“水产动物疾病免疫防控”、“水产动物病原生物学”、“水产动物疾病生态防控”三个研究方向。拥有共聚焦显微镜、流式细胞仪、生物型扫描电子显微镜、超速离心机、全自动生化分析仪、微生物鉴定系统、组织切片系统、实时荧光定量PCR仪等在内的一批大型共享仪器。本研究中心共有40人，其中具有博士学位32人，高级职称24人。河南省学术技术带头人1人，河南省科技创新杰出青年1人，河南省高校创新人才1人，河南省高校科技创新团队1个，河南省创新型科技团队1个。
河南省水产动物疾病控制工程研究中心主要立足于我国北部内陆水域，以高密度、集约化的池塘养殖为研究内容，探索低碳养殖新模式，建立水产动物健康养殖和疾病防控理论体系和技术体系，形成三个特色的研究方向：
水产动物病原生物学：针对近年来沿黄渔区养殖品种中出现的暴发病开展系统研究，分析疾病的发生、发展过程和流行规律，对河南省水产动物重要疾病病原进行分离、鉴定并保存，建立河南省水产动物病原库；对于土著病原，进行系统地生物学研究，为大宗淡水鱼和土著鱼类的疾病防控打下基础；对于关键病原，进行病原生物学、流行病学、诊断和防控等相关研究，弄清其发病机理，建立病原的快速检测技术、切断传播途径，研究防控手段，有效控制疾病的发生。
水产动物疾病免疫防控：采用现代分子生物学、组学和生物信息学等研究技术，以内陆经济鱼类为研究对象，对于水产动物特异性和非特异性免疫和抗病的分子机制进行研究，揭示水产动物免疫和抗病的分子基础，以期提高动物免疫防护能力。研究环境因子对水产动物免疫的影响，以消除或降低不利于水产动物免疫的环境因子作用。
水产动物疾病生态防控：从养殖水环境入手，研究生态操控技术，调控好养殖水环境。分离和筛选本土的光合细菌、芽胞杆菌、酵母菌等益生菌，研发水质改良剂，以调控好养殖水体；采用现代分子生物学和基因工程技术，重组表达抗菌肽、溶菌酶等功能分子，以用于鱼病防控，从而减少抗生素对水体的污染。
河南省水产动物疾病控制工程研究中心为河南省水产动物疾病防控体系建设提供高水平的技术支撑和智力支持，以助力现代渔业体系建设和快速发展。现已成为内陆地区水产动物疾病发生机理、诊断和防控等相关科学研究的重要平台和专业人才培养、成果转化和社会服务的重要基地。
